Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms