Protein–RNA interactions for Protein: Q02252

ALDH6A1, Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH6A1Q02252 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms