Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms