Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms