Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD3P84022 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD3P84022 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD3P84022 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD3P84022 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD3P84022 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD3P84022 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD3P84022 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD3P84022 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD3P84022 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD3P84022 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD3P84022 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD3P84022 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD3P84022 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD3P84022 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD3P84022 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD3P84022 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD3P84022 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD3P84022 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD3P84022 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD3P84022 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD3P84022 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD3P84022 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD3P84022 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD3P84022 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD3P84022 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD3P84022 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD3P84022 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD3P84022 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD3P84022 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD3P84022 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD3P84022 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD3P84022 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD3P84022 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD3P84022 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD3P84022 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD3P84022 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD3P84022 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SMAD3P84022 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMAD3P84022 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMAD3P84022 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMAD3P84022 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMAD3P84022 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMAD3P84022 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMAD3P84022 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMAD3P84022 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMAD3P84022 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMAD3P84022 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMAD3P84022 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMAD3P84022 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMAD3P84022 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms