Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms