Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLK1P49759 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLK1P49759 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLK1P49759 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLK1P49759 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLK1P49759 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLK1P49759 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLK1P49759 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLK1P49759 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLK1P49759 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLK1P49759 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLK1P49759 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLK1P49759 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLK1P49759 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLK1P49759 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLK1P49759 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLK1P49759 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLK1P49759 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLK1P49759 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLK1P49759 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLK1P49759 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLK1P49759 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLK1P49759 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLK1P49759 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CLK1P49759 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLK1P49759 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLK1P49759 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLK1P49759 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLK1P49759 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CLK1P49759 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLK1P49759 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CLK1P49759 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLK1P49759 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLK1P49759 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLK1P49759 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLK1P49759 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLK1P49759 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLK1P49759 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLK1P49759 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLK1P49759 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLK1P49759 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLK1P49759 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLK1P49759 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLK1P49759 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLK1P49759 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLK1P49759 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLK1P49759 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLK1P49759 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLK1P49759 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLK1P49759 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLK1P49759 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLK1P49759 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLK1P49759 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLK1P49759 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CLK1P49759 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLK1P49759 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLK1P49759 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLK1P49759 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLK1P49759 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLK1P49759 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLK1P49759 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CLK1P49759 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLK1P49759 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLK1P49759 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLK1P49759 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLK1P49759 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLK1P49759 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLK1P49759 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLK1P49759 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CLK1P49759 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CLK1P49759 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLK1P49759 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLK1P49759 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CLK1P49759 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLK1P49759 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CLK1P49759 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CLK1P49759 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLK1P49759 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLK1P49759 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLK1P49759 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLK1P49759 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLK1P49759 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLK1P49759 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLK1P49759 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLK1P49759 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLK1P49759 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLK1P49759 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLK1P49759 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLK1P49759 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLK1P49759 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLK1P49759 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLK1P49759 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLK1P49759 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CLK1P49759 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLK1P49759 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLK1P49759 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLK1P49759 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLK1P49759 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLK1P49759 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLK1P49759 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms