Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDF5P43026 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDF5P43026 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GDF5P43026 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDF5P43026 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDF5P43026 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDF5P43026 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDF5P43026 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDF5P43026 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDF5P43026 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDF5P43026 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDF5P43026 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDF5P43026 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDF5P43026 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDF5P43026 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDF5P43026 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDF5P43026 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDF5P43026 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDF5P43026 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDF5P43026 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDF5P43026 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDF5P43026 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDF5P43026 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDF5P43026 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDF5P43026 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDF5P43026 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GDF5P43026 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDF5P43026 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDF5P43026 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDF5P43026 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDF5P43026 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDF5P43026 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDF5P43026 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDF5P43026 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDF5P43026 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDF5P43026 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDF5P43026 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDF5P43026 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDF5P43026 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDF5P43026 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDF5P43026 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDF5P43026 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDF5P43026 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDF5P43026 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDF5P43026 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDF5P43026 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDF5P43026 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDF5P43026 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDF5P43026 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDF5P43026 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDF5P43026 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDF5P43026 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDF5P43026 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDF5P43026 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GDF5P43026 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDF5P43026 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDF5P43026 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GDF5P43026 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDF5P43026 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDF5P43026 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDF5P43026 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDF5P43026 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDF5P43026 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDF5P43026 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDF5P43026 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDF5P43026 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDF5P43026 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDF5P43026 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GDF5P43026 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GDF5P43026 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDF5P43026 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDF5P43026 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDF5P43026 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDF5P43026 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GDF5P43026 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDF5P43026 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDF5P43026 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDF5P43026 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDF5P43026 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDF5P43026 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDF5P43026 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDF5P43026 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDF5P43026 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDF5P43026 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDF5P43026 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDF5P43026 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDF5P43026 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDF5P43026 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDF5P43026 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDF5P43026 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDF5P43026 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDF5P43026 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDF5P43026 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDF5P43026 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDF5P43026 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDF5P43026 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDF5P43026 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDF5P43026 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDF5P43026 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDF5P43026 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms