Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MDH1P40925 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MDH1P40925 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MDH1P40925 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MDH1P40925 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MDH1P40925 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MDH1P40925 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MDH1P40925 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MDH1P40925 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MDH1P40925 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MDH1P40925 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MDH1P40925 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MDH1P40925 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MDH1P40925 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MDH1P40925 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MDH1P40925 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MDH1P40925 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MDH1P40925 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MDH1P40925 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MDH1P40925 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MDH1P40925 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MDH1P40925 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MDH1P40925 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MDH1P40925 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MDH1P40925 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MDH1P40925 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MDH1P40925 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MDH1P40925 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MDH1P40925 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MDH1P40925 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MDH1P40925 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MDH1P40925 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MDH1P40925 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MDH1P40925 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MDH1P40925 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MDH1P40925 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MDH1P40925 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MDH1P40925 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MDH1P40925 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MDH1P40925 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MDH1P40925 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MDH1P40925 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MDH1P40925 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MDH1P40925 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MDH1P40925 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MDH1P40925 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MDH1P40925 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MDH1P40925 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MDH1P40925 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MDH1P40925 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MDH1P40925 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MDH1P40925 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MDH1P40925 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MDH1P40925 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MDH1P40925 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MDH1P40925 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MDH1P40925 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MDH1P40925 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MDH1P40925 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MDH1P40925 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MDH1P40925 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MDH1P40925 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MDH1P40925 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MDH1P40925 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MDH1P40925 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MDH1P40925 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MDH1P40925 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MDH1P40925 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MDH1P40925 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MDH1P40925 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MDH1P40925 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MDH1P40925 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MDH1P40925 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MDH1P40925 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MDH1P40925 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MDH1P40925 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MDH1P40925 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MDH1P40925 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MDH1P40925 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MDH1P40925 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MDH1P40925 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MDH1P40925 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MDH1P40925 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MDH1P40925 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MDH1P40925 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MDH1P40925 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MDH1P40925 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MDH1P40925 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MDH1P40925 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MDH1P40925 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MDH1P40925 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MDH1P40925 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MDH1P40925 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MDH1P40925 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MDH1P40925 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MDH1P40925 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MDH1P40925 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MDH1P40925 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MDH1P40925 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MDH1P40925 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms