Protein–RNA interactions for Protein: P40222

TXLNA, Alpha-taxilin, humanhuman

Predictions only

Length 546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXLNAP40222 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TXLNAP40222 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms