Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDIT3P35638 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms