Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GJA4P35212 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJA4P35212 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJA4P35212 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJA4P35212 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJA4P35212 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GJA4P35212 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJA4P35212 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJA4P35212 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GJA4P35212 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJA4P35212 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJA4P35212 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJA4P35212 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJA4P35212 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJA4P35212 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GJA4P35212 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJA4P35212 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJA4P35212 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJA4P35212 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJA4P35212 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJA4P35212 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJA4P35212 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJA4P35212 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJA4P35212 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJA4P35212 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJA4P35212 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJA4P35212 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GJA4P35212 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJA4P35212 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJA4P35212 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA4P35212 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA4P35212 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA4P35212 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA4P35212 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA4P35212 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA4P35212 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA4P35212 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA4P35212 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA4P35212 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA4P35212 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA4P35212 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA4P35212 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA4P35212 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA4P35212 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA4P35212 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA4P35212 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA4P35212 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA4P35212 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA4P35212 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA4P35212 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA4P35212 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA4P35212 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA4P35212 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA4P35212 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA4P35212 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA4P35212 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA4P35212 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA4P35212 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA4P35212 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA4P35212 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA4P35212 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA4P35212 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA4P35212 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA4P35212 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA4P35212 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA4P35212 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA4P35212 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA4P35212 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA4P35212 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA4P35212 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA4P35212 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA4P35212 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA4P35212 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA4P35212 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA4P35212 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA4P35212 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA4P35212 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA4P35212 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA4P35212 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA4P35212 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA4P35212 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA4P35212 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA4P35212 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA4P35212 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA4P35212 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA4P35212 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA4P35212 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA4P35212 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA4P35212 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA4P35212 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA4P35212 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA4P35212 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA4P35212 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA4P35212 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA4P35212 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA4P35212 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA4P35212 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA4P35212 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA4P35212 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA4P35212 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms