Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPS1P31327 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPS1P31327 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPS1P31327 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPS1P31327 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPS1P31327 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPS1P31327 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPS1P31327 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPS1P31327 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPS1P31327 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPS1P31327 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPS1P31327 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPS1P31327 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPS1P31327 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPS1P31327 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPS1P31327 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPS1P31327 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPS1P31327 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPS1P31327 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPS1P31327 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPS1P31327 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPS1P31327 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPS1P31327 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPS1P31327 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPS1P31327 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPS1P31327 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPS1P31327 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPS1P31327 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPS1P31327 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CPS1P31327 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CPS1P31327 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPS1P31327 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPS1P31327 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPS1P31327 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPS1P31327 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPS1P31327 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPS1P31327 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPS1P31327 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPS1P31327 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPS1P31327 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPS1P31327 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPS1P31327 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CPS1P31327 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPS1P31327 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPS1P31327 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CPS1P31327 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPS1P31327 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPS1P31327 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPS1P31327 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPS1P31327 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPS1P31327 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPS1P31327 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPS1P31327 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPS1P31327 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPS1P31327 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CPS1P31327 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPS1P31327 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPS1P31327 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPS1P31327 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPS1P31327 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPS1P31327 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPS1P31327 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPS1P31327 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPS1P31327 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPS1P31327 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPS1P31327 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPS1P31327 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CPS1P31327 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPS1P31327 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPS1P31327 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPS1P31327 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPS1P31327 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CPS1P31327 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CPS1P31327 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CPS1P31327 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPS1P31327 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPS1P31327 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPS1P31327 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPS1P31327 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPS1P31327 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPS1P31327 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPS1P31327 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPS1P31327 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPS1P31327 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPS1P31327 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPS1P31327 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPS1P31327 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPS1P31327 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPS1P31327 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPS1P31327 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPS1P31327 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPS1P31327 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPS1P31327 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CPS1P31327 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPS1P31327 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPS1P31327 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPS1P31327 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPS1P31327 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPS1P31327 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPS1P31327 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms