Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms