Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms