Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMBRP28336 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMBRP28336 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMBRP28336 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMBRP28336 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMBRP28336 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NMBRP28336 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NMBRP28336 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NMBRP28336 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NMBRP28336 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NMBRP28336 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NMBRP28336 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NMBRP28336 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMBRP28336 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMBRP28336 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMBRP28336 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMBRP28336 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMBRP28336 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMBRP28336 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMBRP28336 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NMBRP28336 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMBRP28336 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMBRP28336 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMBRP28336 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMBRP28336 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMBRP28336 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMBRP28336 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMBRP28336 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMBRP28336 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMBRP28336 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMBRP28336 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMBRP28336 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NMBRP28336 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMBRP28336 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMBRP28336 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMBRP28336 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMBRP28336 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMBRP28336 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMBRP28336 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMBRP28336 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMBRP28336 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMBRP28336 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMBRP28336 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMBRP28336 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMBRP28336 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMBRP28336 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMBRP28336 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMBRP28336 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMBRP28336 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMBRP28336 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMBRP28336 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMBRP28336 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMBRP28336 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMBRP28336 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMBRP28336 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMBRP28336 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMBRP28336 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMBRP28336 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMBRP28336 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMBRP28336 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMBRP28336 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMBRP28336 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMBRP28336 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMBRP28336 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMBRP28336 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMBRP28336 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMBRP28336 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NMBRP28336 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NMBRP28336 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMBRP28336 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMBRP28336 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMBRP28336 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMBRP28336 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMBRP28336 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMBRP28336 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NMBRP28336 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMBRP28336 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMBRP28336 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMBRP28336 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMBRP28336 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMBRP28336 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMBRP28336 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMBRP28336 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMBRP28336 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMBRP28336 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMBRP28336 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMBRP28336 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMBRP28336 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMBRP28336 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMBRP28336 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMBRP28336 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMBRP28336 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMBRP28336 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMBRP28336 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMBRP28336 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NMBRP28336 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMBRP28336 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMBRP28336 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMBRP28336 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMBRP28336 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.4 ms