Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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CXCL3P19876 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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CXCL3P19876 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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CXCL3P19876 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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CXCL3P19876 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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