Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms