Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms