Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms