Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DMDP11532 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DMDP11532 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DMDP11532 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DMDP11532 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DMDP11532 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DMDP11532 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DMDP11532 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DMDP11532 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DMDP11532 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DMDP11532 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DMDP11532 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DMDP11532 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DMDP11532 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DMDP11532 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DMDP11532 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DMDP11532 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DMDP11532 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DMDP11532 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DMDP11532 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DMDP11532 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DMDP11532 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DMDP11532 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DMDP11532 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DMDP11532 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DMDP11532 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DMDP11532 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DMDP11532 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DMDP11532 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DMDP11532 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DMDP11532 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DMDP11532 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DMDP11532 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DMDP11532 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DMDP11532 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DMDP11532 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DMDP11532 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DMDP11532 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DMDP11532 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DMDP11532 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DMDP11532 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DMDP11532 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DMDP11532 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DMDP11532 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DMDP11532 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DMDP11532 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DMDP11532 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DMDP11532 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DMDP11532 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DMDP11532 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DMDP11532 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DMDP11532 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DMDP11532 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DMDP11532 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DMDP11532 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DMDP11532 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DMDP11532 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DMDP11532 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DMDP11532 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DMDP11532 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DMDP11532 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DMDP11532 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DMDP11532 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DMDP11532 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DMDP11532 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DMDP11532 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DMDP11532 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DMDP11532 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DMDP11532 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DMDP11532 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DMDP11532 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DMDP11532 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DMDP11532 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DMDP11532 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DMDP11532 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DMDP11532 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DMDP11532 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DMDP11532 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DMDP11532 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DMDP11532 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DMDP11532 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DMDP11532 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DMDP11532 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DMDP11532 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DMDP11532 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DMDP11532 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DMDP11532 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DMDP11532 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DMDP11532 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DMDP11532 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DMDP11532 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DMDP11532 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DMDP11532 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DMDP11532 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DMDP11532 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DMDP11532 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DMDP11532 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DMDP11532 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DMDP11532 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DMDP11532 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms