Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms