Protein–RNA interactions for Protein: P0DJ93

SMIM13, Small integral membrane protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM13P0DJ93 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 COL6A3-203ENST00000353578 9963 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM13P0DJ93 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms