Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms