Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DENRO43583 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DENRO43583 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DENRO43583 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DENRO43583 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DENRO43583 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DENRO43583 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DENRO43583 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
DENRO43583 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
DENRO43583 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
DENRO43583 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
DENRO43583 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
DENRO43583 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
DENRO43583 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
DENRO43583 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
DENRO43583 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
DENRO43583 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DENRO43583 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DENRO43583 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DENRO43583 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DENRO43583 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DENRO43583 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DENRO43583 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DENRO43583 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DENRO43583 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DENRO43583 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
DENRO43583 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DENRO43583 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DENRO43583 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DENRO43583 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DENRO43583 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DENRO43583 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
DENRO43583 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
DENRO43583 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DENRO43583 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DENRO43583 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DENRO43583 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DENRO43583 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DENRO43583 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
DENRO43583 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DENRO43583 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DENRO43583 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DENRO43583 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DENRO43583 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DENRO43583 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DENRO43583 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DENRO43583 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DENRO43583 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DENRO43583 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DENRO43583 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
DENRO43583 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DENRO43583 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DENRO43583 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
DENRO43583 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DENRO43583 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DENRO43583 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DENRO43583 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DENRO43583 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DENRO43583 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DENRO43583 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DENRO43583 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DENRO43583 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DENRO43583 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DENRO43583 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DENRO43583 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DENRO43583 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DENRO43583 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DENRO43583 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DENRO43583 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DENRO43583 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DENRO43583 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DENRO43583 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DENRO43583 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DENRO43583 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DENRO43583 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DENRO43583 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DENRO43583 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DENRO43583 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DENRO43583 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DENRO43583 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DENRO43583 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DENRO43583 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DENRO43583 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DENRO43583 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DENRO43583 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DENRO43583 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DENRO43583 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DENRO43583 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DENRO43583 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DENRO43583 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DENRO43583 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DENRO43583 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DENRO43583 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DENRO43583 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DENRO43583 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DENRO43583 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DENRO43583 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DENRO43583 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DENRO43583 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
DENRO43583 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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