Protein–RNA interactions for Protein: O43345

ZNF208, Zinc finger protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 1,280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF208O43345 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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ZNF208O43345 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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ZNF208O43345 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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ZNF208O43345 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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ZNF208O43345 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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ZNF208O43345 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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ZNF208O43345 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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ZNF208O43345 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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ZNF208O43345 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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