Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
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