Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KNCNA6PVL3 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms