Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms