Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms