Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms