Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNP9

PPIE, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPIEQ9UNP9 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPIEQ9UNP9 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms