Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.2 ms