Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms