Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms