Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms