Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms