Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms