Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms