Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

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Length 1,192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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PKP4Q99569 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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PKP4Q99569 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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PKP4Q99569 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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PKP4Q99569 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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PKP4Q99569 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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