Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms