Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms