Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms