Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms