Protein–RNA interactions for Protein: Q8N319

C6orf223, Uncharacterized protein C6orf223, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf223Q8N319 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C6orf223Q8N319 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms