Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms