Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTOP1Q7RTM1 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms