Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms