Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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ZBED9Q6R2W3 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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ZBED9Q6R2W3 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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ZBED9Q6R2W3 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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ZBED9Q6R2W3 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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ZBED9Q6R2W3 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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ZBED9Q6R2W3 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
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