Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLX4IPQ5VYV7 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLX4IPQ5VYV7 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLX4IPQ5VYV7 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLX4IPQ5VYV7 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLX4IPQ5VYV7 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLX4IPQ5VYV7 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLX4IPQ5VYV7 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLX4IPQ5VYV7 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLX4IPQ5VYV7 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLX4IPQ5VYV7 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLX4IPQ5VYV7 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLX4IPQ5VYV7 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLX4IPQ5VYV7 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLX4IPQ5VYV7 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLX4IPQ5VYV7 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLX4IPQ5VYV7 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SLX4IPQ5VYV7 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLX4IPQ5VYV7 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLX4IPQ5VYV7 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLX4IPQ5VYV7 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLX4IPQ5VYV7 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLX4IPQ5VYV7 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLX4IPQ5VYV7 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLX4IPQ5VYV7 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLX4IPQ5VYV7 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLX4IPQ5VYV7 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLX4IPQ5VYV7 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLX4IPQ5VYV7 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLX4IPQ5VYV7 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLX4IPQ5VYV7 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLX4IPQ5VYV7 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLX4IPQ5VYV7 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLX4IPQ5VYV7 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SLX4IPQ5VYV7 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLX4IPQ5VYV7 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLX4IPQ5VYV7 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLX4IPQ5VYV7 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SLX4IPQ5VYV7 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLX4IPQ5VYV7 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLX4IPQ5VYV7 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLX4IPQ5VYV7 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLX4IPQ5VYV7 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLX4IPQ5VYV7 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLX4IPQ5VYV7 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLX4IPQ5VYV7 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLX4IPQ5VYV7 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SLX4IPQ5VYV7 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLX4IPQ5VYV7 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLX4IPQ5VYV7 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLX4IPQ5VYV7 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLX4IPQ5VYV7 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLX4IPQ5VYV7 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLX4IPQ5VYV7 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLX4IPQ5VYV7 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLX4IPQ5VYV7 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLX4IPQ5VYV7 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLX4IPQ5VYV7 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLX4IPQ5VYV7 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLX4IPQ5VYV7 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms